تعتبر البروتينات هي اللغة التي تتحدث بها الخلايا، وهذه اللغة تتكون من حروف هي الأحماض الأمينية، فكلما تغير ترتيب الحروف تغيرت الكلمات وبالتالي تغير المفهوم والمعنى، كذا الأمر بالنسبة للبروتينات فكلما تغير ترتيب الأحماض الأمينية تغير مفهوم البروتين وتغيرت وظيفته بالكلية حتى لو كان التغير في حمض أميني واحد.

من هنا فالبروتينات هي المقوم الأساسي للعمليات الحيوية، ومفهوم البروتيوميكس “المجموع البروتيني” هو دراسة تركيب ووظائف البروتينات الخاصة بالخلية أو العضو أو الجهاز أو الكائن الحي، فحينما نقول البروتيوميكس للإنسان نعني ما يحتويه جسم الإنسان من بروتينات خاصة به، وحين نقول البروتيومكس للكبد فنعني مجموع البروتينات الخاصة بالكبد وهذا يشبه تماما معنى الجينومكس التي تتحدث عن مجموع الجينات الخاصة بكائن أو عضو محدد.